西瓜整枝要及時，并且分次進行，一般在主蔓長約50cm，側蔓約15cm時開始整枝，每隔3-5天整枝一次，果實坐住后不再整枝。整枝方式有單蔓整枝，雙蔓整枝，三蔓整枝。單蔓整枝是只保留一條主蔓，此方式適于早熟密植栽培，但坐果率小；雙蔓整枝是除保留主蔓外，在主蔓基部選留一個健壯側蔓，其余側蔓及早摘除。當株距較小、行距較大時，主、側蔓可以向相反的方向生長，否則以雙蔓同向生長為宜。此方式管理簡便，適于密植，坐果率高，在早熟栽培或土壤比較瘠薄的地塊應重點采用；三蔓整枝是除保留主蔓外，在主蔓基部選留兩個健壯，生長勢基本相同的側蔓，其它的側蔓予以摘除，三蔓整枝坐果率高，易獲得高產(chǎn)。也是應用最廣泛的一種方式。